More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4027 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  100 
 
 		 323 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  78.23 
 
 		 321 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  76.78 
 
 		 322 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  65.81 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  63.67 
 
 		 314 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  60.97 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  63.61 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  60 
 
 		 321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  60 
 
 		 321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  61.41 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  60.63 
 
 		 324 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  63.43 
 
 		 314 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  60.76 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  60.45 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  60.58 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  59.81 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  60.76 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  59.26 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  63.58 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  59.26 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  60.06 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  61.34 
 
 		 312 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  59.26 
 
 		 324 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  60.9 
 
 		 325 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  61.34 
 
 		 317 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  60.76 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  60.86 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  62.66 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  58.92 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  58.77 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  58.28 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  59.16 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  57.56 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  56.04 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  58.73 
 
 		 324 aa  374  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  58.09 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  59.29 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  57.78 
 
 		 324 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  56.47 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  56.78 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  56.68 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  56.69 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 317 aa  358  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  55.84 
 
 		 314 aa  358  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  52.37 
 
 		 318 aa  355  5e-97  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  58.73 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  56.11 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  56.15 
 
 		 316 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  55.14 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  56.78 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  58.25 
 
 		 338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  56.01 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  51.42 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  55.21 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  56.96 
 
 		 323 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  56.59 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 323 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  55.21 
 
 		 316 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  56.15 
 
 		 340 aa  348  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 317 aa  348  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  57.41 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  53.94 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  53.94 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 318 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_002978  WD0755  thioredoxin reductase  58.9 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  54.8 
 
 		 319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 316 aa  342  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  54.57 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  55.7 
 
 		 321 aa  342  7e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  57.74 
 
 		 316 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  55.38 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  54.57 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  53.63 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  55.06 
 
 		 320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  55.06 
 
 		 320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  55.06 
 
 		 320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  53.63 
 
 		 319 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  56.78 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  57.59 
 
 		 316 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 321 aa  335  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 321 aa  335  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 321 aa  335  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  55.21 
 
 		 321 aa  335  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 321 aa  335  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>