More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4001 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1301 aa  2571    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 		 1737 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  41.63 
 
 		 1038 aa  169  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  47.55 
 
 		 392 aa  159  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 1067 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 1152 aa  128  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  35.18 
 
 		 1444 aa  126  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 		 1317 aa  126  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 		 1152 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 398 aa  112  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 		 302 aa  109  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 374 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 857 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 1177 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 1177 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 1250 aa  105  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 373 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 704 aa  102  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  37.81 
 
 		 1562 aa  102  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 321 aa  102  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 746 aa  102  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 397 aa  101  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  43.85 
 
 		 341 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 		 345 aa  100  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 307 aa  99.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  32.69 
 
 		 338 aa  99  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.02 
 
 		 295 aa  97.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  36.82 
 
 		 276 aa  97.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 		 325 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 		 275 aa  97.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 380 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.17 
 
 		 312 aa  97.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  41.82 
 
 		 289 aa  97.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 327 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 321 aa  96.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 297 aa  96.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 1015 aa  96.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  55.17 
 
 		 324 aa  96.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.28 
 
 		 2401 aa  95.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 1035 aa  95.1  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 302 aa  94.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 880 aa  94.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 		 386 aa  94.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.96 
 
 		 957 aa  93.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 337 aa  93.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 		 320 aa  92.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 301 aa  92.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  43.88 
 
 		 325 aa  92  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 344 aa  92  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.43 
 
 		 1115 aa  92  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 		 294 aa  92  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 379 aa  91.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 		 349 aa  91.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.43 
 
 		 1119 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 597 aa  90.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  36.43 
 
 		 927 aa  89.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.43 
 
 		 1115 aa  90.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 672 aa  89.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.43 
 
 		 1115 aa  90.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 316 aa  89.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 		 308 aa  89.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  34.59 
 
 		 872 aa  89.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.14 
 
 		 314 aa  89  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 324 aa  89.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 310 aa  89.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 289 aa  89  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  44.66 
 
 		 230 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.81 
 
 		 312 aa  89  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 373 aa  88.6  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  45.16 
 
 		 337 aa  88.2  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 331 aa  88.2  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 235 aa  88.2  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 544 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 		 303 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 		 268 aa  87.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  38.83 
 
 		 326 aa  87.8  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.38 
 
 		 251 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.17 
 
 		 292 aa  87  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.98 
 
 		 326 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 1032 aa  87.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  46.07 
 
 		 344 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 		 689 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 326 aa  87.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 357 aa  86.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 281 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 305 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 		 333 aa  86.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 316 aa  86.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 		 155 aa  85.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 872 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  53.26 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  53.06 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.88 
 
 		 1115 aa  85.1  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.29 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 317 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>