More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3987 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  594  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  39.93 
 
 
333 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  38.1 
 
 
305 aa  169  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  37.54 
 
 
327 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.79 
 
 
305 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  36.33 
 
 
318 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.91 
 
 
333 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  33.44 
 
 
300 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  32.89 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  36 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  36.27 
 
 
313 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  37.98 
 
 
296 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  34.64 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  37.85 
 
 
294 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  34.29 
 
 
303 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  36.14 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.22 
 
 
331 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  31.44 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.07 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  35.02 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  32.05 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  40.96 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  35.64 
 
 
313 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  32.36 
 
 
313 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  33.56 
 
 
317 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  35.51 
 
 
281 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  36.52 
 
 
295 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  31.13 
 
 
319 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 
312 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
312 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
305 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  32.89 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  33.77 
 
 
301 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  31.94 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  36.09 
 
 
288 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  34.66 
 
 
318 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.86 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.77 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.72 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  36.33 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 
339 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  34.27 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  31.89 
 
 
295 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  32.65 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  31.19 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.16 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  32.05 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.66 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.44 
 
 
347 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  31.4 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  32.27 
 
 
317 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  32.27 
 
 
317 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.4 
 
 
292 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
297 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 
333 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
316 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.4 
 
 
311 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.91 
 
 
320 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  29.82 
 
 
301 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 
325 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  29.67 
 
 
292 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.09 
 
 
320 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  30.14 
 
 
304 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.7 
 
 
306 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  33.2 
 
 
287 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  31.43 
 
 
277 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  32.67 
 
 
317 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  34.1 
 
 
311 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.47 
 
 
309 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.55 
 
 
314 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.46 
 
 
313 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
305 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  32.53 
 
 
306 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  30.73 
 
 
293 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.93 
 
 
307 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 
328 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  31.3 
 
 
305 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  30.73 
 
 
293 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  30.73 
 
 
293 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  31.33 
 
 
308 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  34.31 
 
 
305 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  31.65 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.94 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.56 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  32.15 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  30.74 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  33.19 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  32.29 
 
 
289 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>