More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3955 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 		 322 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  67.95 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.34 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.32 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.01 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.56 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.84 
 
 		 339 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.31 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.65 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.03 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.82 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.46 
 
 		 339 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.98 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.72 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.72 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.56 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.34 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.88 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.34 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.05 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.61 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.19 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.14 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.19 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.37 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.94 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.84 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.97 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.95 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.76 
 
 		 329 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.92 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.22 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.38 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.21 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.64 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.89 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.61 
 
 		 346 aa  255  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.72 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.65 
 
 		 312 aa  255  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.57 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.4 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.23 
 
 		 313 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.75 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.94 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.92 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.92 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.12 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.62 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.3 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.85 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.15 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.7 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.49 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.34 
 
 		 313 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.73 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.49 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.54 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.94 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.71 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.71 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.9 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.83 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.23 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.77 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.33 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.33 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.3 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2732  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.73 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.65 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1987  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.88 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3097  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.73 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004498  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.75 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.69 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00894  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.44 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2559  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.04 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3533  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.04 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1339  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.04 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>