More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3858 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 304 aa  603  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  47.94 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  35.74 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  32.09 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  32.09 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  35.68 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  36.67 
 
 		 397 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.38 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.41 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.4 
 
 		 380 aa  95.9  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.31 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.07 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  33.04 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.66 
 
 		 393 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 504 aa  92.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 275 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.22 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  24.09 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  34.64 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.21 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.21 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 		 266 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.55 
 
 		 371 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 340 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  23.1 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 283 aa  89  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.35 
 
 		 425 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  23.1 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  27.51 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>