194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3854 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  57.31 
 
 
598 aa  655    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  55.94 
 
 
590 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  59.25 
 
 
621 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  100 
 
 
593 aa  1212    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  45.88 
 
 
594 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  44.38 
 
 
601 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  44.76 
 
 
601 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  44.76 
 
 
601 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  45.13 
 
 
619 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  41.84 
 
 
603 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  42.93 
 
 
599 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  45.44 
 
 
603 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  44.57 
 
 
601 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  41.84 
 
 
603 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  45.44 
 
 
603 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  45.04 
 
 
603 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  44.4 
 
 
591 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  43.87 
 
 
602 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  45.02 
 
 
599 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  45.74 
 
 
599 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  45.71 
 
 
613 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  43.11 
 
 
587 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  39.49 
 
 
595 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  42.26 
 
 
583 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  41.21 
 
 
589 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  41.52 
 
 
588 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  43.41 
 
 
584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  38.72 
 
 
1283 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.8 
 
 
586 aa  340  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  36.47 
 
 
611 aa  329  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  37.86 
 
 
609 aa  327  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  35.82 
 
 
616 aa  323  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  41.1 
 
 
611 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  34.99 
 
 
609 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  34.81 
 
 
609 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  34.81 
 
 
609 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  38.94 
 
 
609 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  40.62 
 
 
609 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.81 
 
 
609 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  40.84 
 
 
609 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  39.64 
 
 
619 aa  320  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  38.22 
 
 
607 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  36.03 
 
 
629 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  35.09 
 
 
616 aa  316  7e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  33.98 
 
 
610 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  37.19 
 
 
609 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  38.93 
 
 
566 aa  306  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  37.92 
 
 
589 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  36.1 
 
 
609 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  35.27 
 
 
611 aa  300  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  36.83 
 
 
592 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  43.06 
 
 
628 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  34.64 
 
 
610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.36 
 
 
637 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  33.21 
 
 
585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  39.19 
 
 
610 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  31.81 
 
 
635 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.88 
 
 
602 aa  276  8e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  34.81 
 
 
621 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  34.01 
 
 
593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  32.47 
 
 
615 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  32.58 
 
 
617 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  43.71 
 
 
605 aa  270  7e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.77 
 
 
614 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  32.48 
 
 
615 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  32.29 
 
 
615 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  32.48 
 
 
615 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  32.26 
 
 
616 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.04 
 
 
605 aa  264  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  32.08 
 
 
616 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  32.26 
 
 
616 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  32.08 
 
 
616 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  31.54 
 
 
618 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  30.91 
 
 
628 aa  257  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  35.27 
 
 
625 aa  254  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  34.27 
 
 
625 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  40.39 
 
 
547 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  33.98 
 
 
593 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  32.45 
 
 
613 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  33.27 
 
 
611 aa  250  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  31.46 
 
 
627 aa  249  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  30.49 
 
 
624 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.03 
 
 
613 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  37.84 
 
 
551 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  38.87 
 
 
629 aa  243  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 
608 aa  242  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  30.49 
 
 
646 aa  240  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  33.93 
 
 
608 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  32.02 
 
 
614 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  31.34 
 
 
614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  30.71 
 
 
618 aa  234  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  30.98 
 
 
614 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  30.3 
 
 
608 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  30.98 
 
 
617 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  30.8 
 
 
614 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  31.9 
 
 
607 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  31.9 
 
 
607 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  31.9 
 
 
607 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  36.56 
 
 
617 aa  229  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  31.08 
 
 
635 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>