More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3823 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  87.06 
 
 		 406 aa  741    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  86.32 
 
 		 406 aa  739    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 404 aa  837    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  66.34 
 
 		 408 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  64.99 
 
 		 407 aa  531  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  63.12 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  64.3 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  60.3 
 
 		 410 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  61.54 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  59.9 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  61.39 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  62.28 
 
 		 409 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  59.9 
 
 		 409 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  63.04 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  62.28 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  62.53 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  59.41 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  61.43 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  58.66 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  62.53 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  61.54 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  60.93 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  61.29 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  57.92 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  61.14 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  61.25 
 
 		 407 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  58.91 
 
 		 409 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  60.89 
 
 		 403 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  62.25 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  61.27 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  62 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  60.44 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  61.14 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  60.44 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  60.79 
 
 		 430 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  58.06 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  57.32 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  59.85 
 
 		 431 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  57.82 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  57.82 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  57.61 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  56.85 
 
 		 407 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  55.09 
 
 		 439 aa  461  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  54.11 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  57.14 
 
 		 404 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  54.25 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  54.95 
 
 		 435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  56.09 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  51.98 
 
 		 402 aa  448  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  55.84 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  56.42 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  52.61 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  50 
 
 		 648 aa  418  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  57.62 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  47.85 
 
 		 608 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  51.76 
 
 		 416 aa  395  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  48.14 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  46.39 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  48.55 
 
 		 400 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.29 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.02 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  38.46 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.77 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.582044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3756  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.78 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.399455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.65 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.51 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.68 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.26 
 
 		 402 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.39 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  36.66 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.03 
 
 		 395 aa  219  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.68 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.42 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.19 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.39 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.92 
 
 		 501 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.58 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.35 
 
 		 391 aa  216  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.32 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.29 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.01 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.71 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.5 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.73 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.73 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.73 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.04 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.76 
 
 		 396 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>