54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3807 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 
323 aa  666    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  63.98 
 
 
320 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  46.11 
 
 
320 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  31.8 
 
 
603 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
285 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
285 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 
275 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
279 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  33.22 
 
 
607 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 
278 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
296 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
302 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
309 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  27.81 
 
 
304 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
320 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  26.22 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  27.42 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  28.19 
 
 
298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  30.26 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  27.61 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  36.17 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  30.13 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
308 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  32.37 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  28.97 
 
 
276 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  27.83 
 
 
276 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
313 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  30 
 
 
305 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
289 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
308 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
301 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
349 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 
333 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
276 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  25 
 
 
294 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
322 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  27.67 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
287 aa  89  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  24.58 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  24.44 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  26.07 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 
240 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>