244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3774 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3774  7-cyano-7-deazaguanine reductase  100 
 
 
150 aa  308  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  88.19 
 
 
156 aa  264  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2551  7-cyano-7-deazaguanine reductase  82.67 
 
 
166 aa  261  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.914539  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2817  7-cyano-7-deazaguanine reductase  76.71 
 
 
158 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153581  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2779  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.83 
 
 
158 aa  237  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4472  7-cyano-7-deazaguanine reductase  75.17 
 
 
158 aa  234  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  0.783738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1742  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.47 
 
 
158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2482  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.1 
 
 
158 aa  230  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.245028  normal  0.291037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1828  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.41 
 
 
158 aa  229  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5893  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.67 
 
 
150 aa  226  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3756  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.61 
 
 
151 aa  226  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.74 
 
 
155 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3217  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.47 
 
 
158 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6510  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.67 
 
 
150 aa  222  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3151  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.83 
 
 
154 aa  221  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0333619  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2044  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.53 
 
 
154 aa  221  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4288  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68 
 
 
150 aa  221  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1311  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.46 
 
 
159 aa  220  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3262  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.75 
 
 
154 aa  221  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1183  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.1 
 
 
155 aa  219  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1144  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.1 
 
 
155 aa  219  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.594767  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4182  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.53 
 
 
154 aa  219  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0000104861  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1844  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.33 
 
 
174 aa  218  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2906  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.53 
 
 
153 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.61276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1463  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.63 
 
 
152 aa  217  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2808  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.57 
 
 
154 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146173  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3074  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.57 
 
 
154 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2293  7-cyano-7-deazaguanine reductase  69.44 
 
 
154 aa  214  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.158019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2783  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.83 
 
 
153 aa  213  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3011  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.83 
 
 
153 aa  213  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  66.89 
 
 
162 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0442  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.97 
 
 
153 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0512  7-cyano-7-deazaguanine reductase  69.44 
 
 
153 aa  207  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.642782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1341  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.36 
 
 
154 aa  206  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1060  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.06 
 
 
153 aa  206  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.356271  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.97 
 
 
155 aa  153  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.42 
 
 
99 aa  140  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0872  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.46 
 
 
163 aa  120  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.697802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1067  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1397  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0769  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.21 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0751  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.21 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3946  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105864  normal  0.027298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1260  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1235  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1362  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0220025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1500  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000420055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1259  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1433  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000199367 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0394  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.62 
 
 
166 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1233  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.91 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.28 
 
 
180 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.883565  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1773  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.54 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.29 
 
 
154 aa  114  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1644  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.4 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22450  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.46 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.914422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2025  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0305179  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.08 
 
 
188 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1227  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44 
 
 
139 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0657865  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.94 
 
 
167 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0752  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.79 
 
 
141 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.384081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0899  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.79 
 
 
141 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.826218  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.14 
 
 
144 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1886  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.94 
 
 
136 aa  102  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3304  GTP cyclohydrolase I  44.36 
 
 
143 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0577571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1809  GTP cyclohydrolase I-related enzyme  47.57 
 
 
161 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4219  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.09 
 
 
122 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4244  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.09 
 
 
122 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0237434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0644  GTP cyclohydrolase I  46.3 
 
 
139 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.486051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0160  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.15 
 
 
129 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4094  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.28 
 
 
159 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0823325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0331  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.28 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0279234  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0678  GTP cyclohydrolase I  46.46 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2723  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.12 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2441  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.67 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00534909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3421  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0847539  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1400  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.41 
 
 
139 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2027  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.45 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1696  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.52 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.510769  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1181  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.66 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15801  GTP cyclohydrolase I-like protein  41.75 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1881  GTP cyclohydrolase I  44 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1578  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.67 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.921264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0840  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.14 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000632254  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0471  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.78 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.38 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2205  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.18 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.709249  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0579  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.81 
 
 
118 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0561  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.86 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0230  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.89 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0282  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.39 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.290856  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1627  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.86 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0004  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.93 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2098  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.95 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.819295  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16511  7-cyano-7-deazaguanine reductase  36.36 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0006  NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase (NADPH-dependent nitrile oxidoreductase)  37.93 
 
 
184 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18601  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.95 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.780472  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04701  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.36 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>