More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3759 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  100 
 
 		 529 aa  1075    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  39.85 
 
 		 544 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 613 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 608 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  33.46 
 
 		 560 aa  256  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 569 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  32.9 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  31.32 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 564 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  32.6 
 
 		 573 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 564 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  34.91 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  34.3 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 569 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.64 
 
 		 575 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 596 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.94 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.31 
 
 		 542 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.24 
 
 		 574 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.3 
 
 		 553 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.45 
 
 		 601 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.22 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.63 
 
 		 550 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 543 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.3 
 
 		 580 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 583 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 583 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.47 
 
 		 603 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.37 
 
 		 616 aa  164  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  28.92 
 
 		 580 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.38 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 606 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.24 
 
 		 556 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.39 
 
 		 532 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.69 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  26.39 
 
 		 582 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  26.25 
 
 		 563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  26.91 
 
 		 592 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 563 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.82 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 620 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  27.35 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 589 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.73 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.89 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 587 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 553 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 560 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.82 
 
 		 557 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  32.04 
 
 		 536 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 544 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  27.34 
 
 		 576 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  25.31 
 
 		 583 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 556 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.35 
 
 		 530 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.36 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.3 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  27.26 
 
 		 648 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.38 
 
 		 564 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  25.13 
 
 		 583 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 556 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 619 aa  140  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  25.93 
 
 		 558 aa  140  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.48 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.05 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 543 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.14 
 
 		 560 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.77 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.91 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 568 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  27.9 
 
 		 625 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.73 
 
 		 575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.35 
 
 		 604 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  25.57 
 
 		 555 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.28 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  24.44 
 
 		 544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.03 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.93 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.05 
 
 		 581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.58 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.42 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.88 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 601 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.37 
 
 		 601 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.32 
 
 		 540 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.06 
 
 		 539 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  25.87 
 
 		 565 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  23.21 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.6 
 
 		 583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  31.14 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>