68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3755 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  42.86 
 
 		 359 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  45.54 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  30.16 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  32.59 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  33.59 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  33.59 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  31.09 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  33.59 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  33.59 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  32.54 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  32.03 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  29.66 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1877  hypothetical protein  28.18 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2097  hypothetical protein  25.78 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  27.87 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  27.34 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  25.19 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  32 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  24.43 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  22.96 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  31.2 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  31.2 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  31.2 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  25 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  31.2 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  30.47 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  23.66 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  29.75 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.57 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  19.26 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  25.76 
 
 		 1420 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  23.33 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  25.21 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  23.33 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  25.71 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  25.71 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  23.58 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  24.17 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  25.71 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  23.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  23.33 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  27.82 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0440  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  17.78 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  25.83 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  18.52 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6844  hypothetical protein  26.89 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0787  hypothetical protein  21.67 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0827  hypothetical protein  21.67 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000717124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  22.66 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  22.66 
 
 		 134 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  25.78 
 
 		 134 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3511  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  26.36 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  26.36 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  26.36 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1848  ankyrin  25 
 
 		 495 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>