More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3687 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 300 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  53.87 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  55.95 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  65.34 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  47.33 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  52.73 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  54.67 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 		 272 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  55.71 
 
 		 258 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  68.15 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  54.02 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  56.42 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  61.5 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  54.84 
 
 		 257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  51.64 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  63.28 
 
 		 242 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  53.92 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  66.01 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  51.63 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  51.63 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  53.69 
 
 		 197 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  52.17 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  49.58 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  47.23 
 
 		 238 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  49.77 
 
 		 233 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  47.52 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  45.64 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 233 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  63.46 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  51.72 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  50.79 
 
 		 223 aa  152  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  42.44 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  50.37 
 
 		 439 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  40.43 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  50.77 
 
 		 484 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  50.81 
 
 		 210 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  59.34 
 
 		 120 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  47.9 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  47.93 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  43.15 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  44.52 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  44.52 
 
 		 209 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  46.92 
 
 		 199 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  47.93 
 
 		 260 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 		 209 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  48.74 
 
 		 196 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 		 245 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.3 
 
 		 206 aa  92.8  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  43.2 
 
 		 146 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.96 
 
 		 233 aa  92.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.74 
 
 		 174 aa  92  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  45.38 
 
 		 196 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 191 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  46.22 
 
 		 198 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  43.88 
 
 		 195 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.46 
 
 		 226 aa  85.9  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 202 aa  85.9  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  45.22 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  47.15 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  45.83 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  45.69 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  47.32 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  42.62 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  41.67 
 
 		 197 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  46.61 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  42.45 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  39.31 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  42.52 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.5 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  45 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  44.23 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  40.87 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.24 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  43.8 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  38.35 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  38.97 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  36.24 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  35.34 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  35.34 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  43.44 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>