218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3659 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  70.55 
 
 		 317 aa  434  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  67.31 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  58.44 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  62.38 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  57.93 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  58.12 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  59.54 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  58.63 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  56.91 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  59.03 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  58.25 
 
 		 311 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  52.94 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  51.96 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  52.29 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  58.55 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  54.58 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  53.92 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  53.92 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  59.33 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  57.95 
 
 		 301 aa  348  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  57.43 
 
 		 299 aa  348  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  56.03 
 
 		 319 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  53.59 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  53.59 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  53.59 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  53.59 
 
 		 334 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  52.44 
 
 		 326 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  52.94 
 
 		 333 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  52.61 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  52.94 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  55.59 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  53.75 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  54.13 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  51.62 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  53.59 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  51.96 
 
 		 341 aa  337  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  51.97 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  53.09 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  52.29 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  50.65 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  52.51 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  50.17 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  50.63 
 
 		 350 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  51.82 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  50.83 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  51.5 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  51.16 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  50.83 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  50 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  48.54 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  50.16 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  49.51 
 
 		 317 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  51.5 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  51.44 
 
 		 339 aa  319  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  50.16 
 
 		 326 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  49.19 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  51.16 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  50.5 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  52.12 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  54.75 
 
 		 555 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  48.83 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  47.24 
 
 		 319 aa  311  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  63.87 
 
 		 242 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  48.83 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  47.59 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  48.83 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  51.53 
 
 		 306 aa  308  8e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  48.47 
 
 		 294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  46.9 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  50.17 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  48.81 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  43.79 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  46.55 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  51.57 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  53.6 
 
 		 255 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  50 
 
 		 269 aa  255  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  51 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  51.6 
 
 		 255 aa  252  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  41.03 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  40.34 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  39.66 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  42.92 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  43.9 
 
 		 623 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  42.64 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  42.5 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  42.8 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  40.15 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  38.87 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  41.48 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  39.26 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  40.29 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>