More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3651 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 387 aa  781    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  62.83 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  45.03 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  45.71 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  44.39 
 
 		 390 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.3 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  40.51 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  45.28 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  45.53 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  46.65 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  45.13 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  43.64 
 
 		 390 aa  262  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  44.87 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  44.87 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  45.36 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  40.81 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  44.56 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  41.88 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  41.56 
 
 		 390 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  43.35 
 
 		 389 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  42.74 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  46.24 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.9 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  40.91 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  40.36 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  42.67 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.76 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  40 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  40.61 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.19 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  41.29 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  37.31 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  38.99 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.47 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  38.67 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  38.79 
 
 		 393 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.6 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  39.79 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  39.9 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  35.73 
 
 		 541 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.28 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  37.1 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  36.1 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  38.32 
 
 		 550 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.36 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  38.62 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  38.07 
 
 		 550 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  38.07 
 
 		 550 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  38.5 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  38.36 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.08 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  38.6 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.96 
 
 		 548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  34.29 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  38.6 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.11 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  38.93 
 
 		 548 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.01 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  38.08 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.44 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  38.61 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  35.7 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.64 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  37.12 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  33.82 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  39.45 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.2 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.87 
 
 		 386 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.2 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.2 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  37.05 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.95 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  35.5 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.93 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.93 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.67 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  33.7 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.87 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.87 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  36.77 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  36.89 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  36.9 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  36.34 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  36.13 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  35.55 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  36.29 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  35.81 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.93 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.54 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  38.73 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  36.16 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.61 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  35.35 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  36.88 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  36.88 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.15 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.43 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.96 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  33.5 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>