226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3646 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  796    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  50.97 
 
 		 405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  28.93 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.3 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 409 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 409 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 423 aa  89  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  23.76 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  23.77 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  27.86 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  23.55 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  29.51 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  29.22 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  27.35 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.46 
 
 		 529 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 		 388 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  26.14 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  28.57 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 484 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  26.61 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.81 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  27.03 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  28.17 
 
 		 472 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  28.17 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  28.57 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  28.17 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  30.58 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  28.57 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  28.17 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  28.57 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  28.17 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  28.57 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  28.17 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 682 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  28.57 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  28.17 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 682 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 483 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  27.05 
 
 		 518 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 682 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2570  hypothetical protein  26.92 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  24.65 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 509 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  27.01 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 494 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 542 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  29.06 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1655  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000237125  hitchhiker  0.00412211 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>