215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3609 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  65.38 
 
 		 598 aa  809    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  74.41 
 
 		 594 aa  902    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  56.48 
 
 		 603 aa  691    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 598 aa  1225    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  52.68 
 
 		 624 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  51.26 
 
 		 593 aa  628  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  52.94 
 
 		 598 aa  626  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  52.02 
 
 		 606 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  53.2 
 
 		 606 aa  621  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  52.02 
 
 		 620 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  53.03 
 
 		 606 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  51.6 
 
 		 599 aa  613  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  52.02 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  51.43 
 
 		 598 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  52.33 
 
 		 618 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  51.6 
 
 		 657 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  52.48 
 
 		 595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  50.67 
 
 		 596 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  49.49 
 
 		 589 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  52.2 
 
 		 595 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  51.53 
 
 		 593 aa  581  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  50.93 
 
 		 592 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  47.88 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  47.55 
 
 		 597 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  36.46 
 
 		 593 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  37.39 
 
 		 593 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  35.67 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  36.54 
 
 		 596 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33.33 
 
 		 627 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  32.77 
 
 		 625 aa  273  7e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  34.04 
 
 		 623 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  34.67 
 
 		 586 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  34.56 
 
 		 595 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  32.78 
 
 		 842 aa  270  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  33.55 
 
 		 623 aa  270  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  34.51 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  32.61 
 
 		 600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  33.95 
 
 		 598 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  32.43 
 
 		 602 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 		 605 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  33.77 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  32.41 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  33.55 
 
 		 609 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 		 611 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  32.5 
 
 		 605 aa  259  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 612 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  33.33 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  33.01 
 
 		 619 aa  258  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  32.11 
 
 		 786 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  33.67 
 
 		 605 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 602 aa  257  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 		 609 aa  257  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.66 
 
 		 597 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  33.11 
 
 		 611 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  31.67 
 
 		 599 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  33.56 
 
 		 601 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  32.52 
 
 		 629 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  32.08 
 
 		 612 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  32.22 
 
 		 626 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  32.13 
 
 		 847 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 		 594 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  32.68 
 
 		 611 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  32.08 
 
 		 628 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  32.08 
 
 		 626 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  31.91 
 
 		 850 aa  251  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  33.22 
 
 		 665 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  33 
 
 		 621 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  31.68 
 
 		 844 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  33.77 
 
 		 601 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  31.87 
 
 		 599 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  32.19 
 
 		 627 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.51 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  30.64 
 
 		 598 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  39.16 
 
 		 696 aa  247  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  32.5 
 
 		 617 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  33.61 
 
 		 616 aa  247  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  32.21 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  32.94 
 
 		 627 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  32.38 
 
 		 602 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  32.34 
 
 		 645 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 617 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  33.72 
 
 		 867 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  31.64 
 
 		 619 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  32.63 
 
 		 624 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  32.89 
 
 		 602 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  33.17 
 
 		 594 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  31.7 
 
 		 600 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  32.23 
 
 		 619 aa  244  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  32.94 
 
 		 603 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>