180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3608 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  46.02 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  44.44 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  43.1 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  39.11 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  41.96 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  38.08 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  36.75 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  37.66 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  36.92 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  39.68 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  39.27 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  40 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  39.27 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  39.27 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  41.53 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  39.27 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  37.6 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  36.44 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  36.44 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2062  HAD family hydrolase  41.35 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20898  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  37.45 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  38.08 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  37.02 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  38.77 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  38.77 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  38.77 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  36.65 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  36.65 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.24 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.9 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  40.17 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.46 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  37.21 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  38.75 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  40.17 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  40.48 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  39.51 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  40.17 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  35.46 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  36.93 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  38.78 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  38.43 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  37.76 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.2 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  38.2 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.2 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  34.14 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.2 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.14 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  38.2 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.2 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.2 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.2 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  38.07 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  38.01 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  36.78 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  37.19 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  38.01 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  37.08 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.19 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.1 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.55 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  36.78 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  36.78 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  36.1 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.26 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.47 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.71 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  36.1 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  35.47 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  35.47 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.02 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  32.77 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  34.73 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.2 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  36.2 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  37.82 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  34.74 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  37.38 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  36.55 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  35.34 
 
 		 744 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  35.15 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.58 
 
 		 525 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  37.97 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  34.18 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 		 271 aa  88.6  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  33.47 
 
 		 346 aa  88.6  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  34.32 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  34.14 
 
 		 1225 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0483  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.96 
 
 		 723 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.967333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  35.41 
 
 		 391 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0478  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.96 
 
 		 723 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0393601  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43599  predicted protein  31.4 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal  0.825443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0866  HAD family hydrolase  37.8 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>