205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3606 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  802    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  63.98 
 
 
214 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  55.71 
 
 
214 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  55.24 
 
 
214 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0842  hypothetical protein  58.96 
 
 
215 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  50.95 
 
 
214 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  49.07 
 
 
214 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  47.2 
 
 
214 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0776  hypothetical protein  52.58 
 
 
213 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  48.6 
 
 
218 aa  216  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  48.13 
 
 
214 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  48.6 
 
 
214 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  49.3 
 
 
213 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  47.2 
 
 
215 aa  209  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  48.36 
 
 
213 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  48.57 
 
 
214 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  36.49 
 
 
208 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  36.02 
 
 
208 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  36.02 
 
 
208 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  36.02 
 
 
208 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  35.55 
 
 
211 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  36.02 
 
 
208 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  35.55 
 
 
208 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  35.55 
 
 
208 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  36.02 
 
 
208 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  36.02 
 
 
208 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  36.02 
 
 
208 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  36.02 
 
 
208 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  34.6 
 
 
211 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  36.02 
 
 
208 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  34.6 
 
 
211 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  34.12 
 
 
211 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  34.6 
 
 
208 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  34.6 
 
 
208 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 
165 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  35.55 
 
 
208 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  32.41 
 
 
215 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  45.04 
 
 
166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 
181 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  32.87 
 
 
215 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  34.26 
 
 
215 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  34.26 
 
 
215 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
166 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  49.24 
 
 
190 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  33.18 
 
 
215 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  33.8 
 
 
215 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  34.72 
 
 
214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
170 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  34.1 
 
 
215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  34.26 
 
 
215 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  34.26 
 
 
215 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
163 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 
170 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
144 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
246 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  31.63 
 
 
212 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
163 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  32.85 
 
 
208 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  33.8 
 
 
215 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  31.55 
 
 
206 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.52 
 
 
162 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  30 
 
 
210 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  34.45 
 
 
209 aa  100  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  32.21 
 
 
211 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  31.1 
 
 
205 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  29.47 
 
 
205 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  28.5 
 
 
208 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
152 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  29.38 
 
 
205 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  33.49 
 
 
219 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
176 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  32.35 
 
 
205 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  30.84 
 
 
217 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  30.09 
 
 
215 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
464 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  39.39 
 
 
141 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
156 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 
205 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  32.54 
 
 
209 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 
205 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  28.99 
 
 
209 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  30.39 
 
 
205 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  31.43 
 
 
206 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
176 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  42.14 
 
 
159 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
138 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  29.67 
 
 
209 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>