215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3582 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 431 aa  864    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  47.89 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  45.95 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  43.75 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  46.67 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  45.93 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  45.68 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  45.68 
 
 		 448 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  43.27 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  44.88 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  45.27 
 
 		 448 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  40.39 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  36.87 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  33.79 
 
 		 439 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  38.79 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  38.5 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  35.52 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  31.18 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  33.25 
 
 		 602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  32.77 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  33.83 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  34.27 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  33.68 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  32.45 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  31.76 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  34 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  31.95 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  30.17 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  34.15 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  35.84 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  33.9 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.77 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  32.2 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.58 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  35.06 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.97 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  30.49 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  31.82 
 
 		 390 aa  136  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.68 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.03 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  29.76 
 
 		 388 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  30.34 
 
 		 311 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  30.21 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  29.01 
 
 		 307 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  28.45 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  24.6 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.09 
 
 		 348 aa  113  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.65 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  26.79 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  25 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  25.28 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  28.53 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  41.38 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.08 
 
 		 346 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.32 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  23.51 
 
 		 323 aa  103  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  27.98 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.3 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  26.3 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.56 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  25.22 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  24.19 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  22.99 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  22.99 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  22.99 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  22.99 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  22.99 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  23.96 
 
 		 323 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  26.65 
 
 		 352 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  22.99 
 
 		 323 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  22.99 
 
 		 323 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  21.88 
 
 		 317 aa  94.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  38.51 
 
 		 337 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  33.5 
 
 		 359 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  31.49 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.87 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  26.06 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.87 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  25.66 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  22.86 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  23.64 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  23.64 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  25.66 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 		 327 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  26.6 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  33.97 
 
 		 306 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  28.75 
 
 		 307 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  26.92 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  35.06 
 
 		 335 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  29.76 
 
 		 377 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  28.75 
 
 		 307 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  27.61 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  23.64 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  30.25 
 
 		 307 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  25.68 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  25.62 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  26.06 
 
 		 355 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.06 
 
 		 355 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  25.78 
 
 		 320 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>