More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3561 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
713 aa  1455    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 
819 aa  326  7e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
821 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 
771 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  33.38 
 
 
691 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 
771 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 
730 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
829 aa  300  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 
860 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
850 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
723 aa  296  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 
799 aa  296  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
769 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 
767 aa  294  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
778 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 
815 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  31.81 
 
 
808 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
837 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 
709 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 
829 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  31.48 
 
 
708 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  31.15 
 
 
703 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.65 
 
 
747 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  31.15 
 
 
703 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.62 
 
 
703 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 
864 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  31.03 
 
 
729 aa  281  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  30.76 
 
 
729 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  31.15 
 
 
729 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  30.58 
 
 
729 aa  280  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 
779 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.27 
 
 
747 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 
721 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  32.64 
 
 
801 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 
743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 
817 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.26 
 
 
752 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
859 aa  273  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 
799 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
733 aa  272  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  30.34 
 
 
715 aa  271  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 
717 aa  271  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  30.83 
 
 
747 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 
735 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  30.88 
 
 
747 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.32 
 
 
833 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
806 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
748 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  30.7 
 
 
747 aa  267  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  30.59 
 
 
747 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  30.8 
 
 
745 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 
717 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 
744 aa  266  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 
828 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
797 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 
745 aa  264  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.2 
 
 
797 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 
744 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 
745 aa  263  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
719 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 
747 aa  263  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 
862 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.8 
 
 
799 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  30.7 
 
 
747 aa  263  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  29.73 
 
 
716 aa  263  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  30.56 
 
 
729 aa  262  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 
757 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 
808 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 
817 aa  259  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.66 
 
 
806 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 
708 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 
825 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 
737 aa  257  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 
736 aa  257  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 
717 aa  256  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 
802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 
825 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  29.56 
 
 
724 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 
715 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 
822 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 
745 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
701 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
810 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
703 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
734 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
738 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 
701 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 
705 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 
714 aa  251  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 
740 aa  250  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
831 aa  250  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 
689 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 
750 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 
696 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 
701 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 
713 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  29.72 
 
 
696 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 
810 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 
741 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 
711 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>