217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3547 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  70.43 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  68.21 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  55.26 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  54.64 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  54.79 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  50.83 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  47.84 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  49.17 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  47.51 
 
 		 307 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  49.83 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  49.5 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  50.17 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  52.65 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  48.5 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  50.99 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  50.17 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  50.66 
 
 		 306 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  51.32 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  50.99 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  47.37 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  50.49 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  44.08 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  47.12 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  44.37 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  45.39 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  42.05 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  45.03 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  47.65 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  42.81 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  43.42 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  44.04 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  43.43 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  44.12 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  42.05 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  35.06 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  44.52 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  33.46 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.89 
 
 		 350 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  31.12 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  34.47 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  29.04 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  29.45 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  27.24 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  34.33 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  29.79 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  29.92 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  28.25 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  31.06 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  33.97 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  30.61 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  26.89 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  27.17 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  26.71 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  27.11 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  26.48 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  36.21 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  30.51 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.81 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  26.84 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  26.84 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  31.05 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  29.56 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  25.99 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.48 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  32.2 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  29.93 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  28.29 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.91 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  28.91 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.46 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  26.69 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  26.26 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  30.84 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.43 
 
 		 2798 aa  59.7  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  26.04 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.91 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  28.01 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  33.63 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  25.17 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25.2 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.36 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  25.09 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  26.67 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  27.95 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  38.24 
 
 		 119 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.04 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  25.36 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  26.06 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  24.82 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  27.24 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>