10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3471 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3471  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150109  unclonable  0.000000661648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3977  hypothetical protein  40.48 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122646  normal  0.324418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0431  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0528081  unclonable  0.000000000073878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1624  hypothetical protein  27.98 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.516254  normal  0.956767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3356  hypothetical protein  29.27 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  unclonable  0.00000000212393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3865  hypothetical protein  29.95 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.0000000000000721521  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4793  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3664  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000112118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3815  hypothetical protein  27.33 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000487259  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4599  hypothetical protein  27.41 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>