298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3374 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
588 aa  1159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  50.79 
 
 
573 aa  459  1e-128  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  47.07 
 
 
522 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  36.51 
 
 
523 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  36.51 
 
 
523 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  34.36 
 
 
557 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  34.63 
 
 
495 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  34.74 
 
 
495 aa  202  1e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  32.79 
 
 
536 aa  202  2e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  35.05 
 
 
495 aa  201  4e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.69 
 
 
536 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  30.59 
 
 
534 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  30.76 
 
 
541 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  31.05 
 
 
536 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  38.12 
 
 
487 aa  194  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 
525 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 
528 aa  191  3e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  31.08 
 
 
535 aa  191  3e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  30.91 
 
 
536 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  31.83 
 
 
540 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  36.27 
 
 
543 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
532 aa  183  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  33.42 
 
 
507 aa  183  9e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.16 
 
 
507 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  31.18 
 
 
502 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 
524 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  32 
 
 
532 aa  176  1e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  38.32 
 
 
497 aa  175  2e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 
509 aa  174  3e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  37.3 
 
 
543 aa  174  3e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  4.81156e-12 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 
532 aa  174  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
508 aa  171  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  36.2 
 
 
556 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  31.03 
 
 
534 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  36.36 
 
 
566 aa  170  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  36.34 
 
 
553 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  32.65 
 
 
531 aa  168  3e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  34.7 
 
 
576 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  34.08 
 
 
534 aa  167  6e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  35.77 
 
 
567 aa  167  6e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 
505 aa  166  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 
515 aa  166  1e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 
515 aa  166  1e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 
515 aa  166  1e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  33.59 
 
 
510 aa  165  2e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  36.43 
 
 
567 aa  166  2e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.65 
 
 
509 aa  165  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
529 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
529 aa  164  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
529 aa  164  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  32.39 
 
 
541 aa  164  4e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
529 aa  164  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
529 aa  164  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.52 
 
 
512 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  31.72 
 
 
510 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  29.66 
 
 
489 aa  163  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  29.93 
 
 
521 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  32.8 
 
 
521 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
512 aa  161  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
512 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
512 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
509 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  32 
 
 
523 aa  160  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
512 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 
550 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
512 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
512 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
509 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.09 
 
 
512 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
507 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  35.71 
 
 
477 aa  157  5e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
510 aa  157  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
520 aa  157  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30.99 
 
 
503 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 
500 aa  155  3e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 
537 aa  154  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  29.27 
 
 
511 aa  154  6e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
525 aa  154  6e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 
503 aa  153  9e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  28.68 
 
 
487 aa  153  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  27.91 
 
 
518 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  32.11 
 
 
528 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  32.02 
 
 
506 aa  151  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  30.99 
 
 
472 aa  150  5e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  34.65 
 
 
502 aa  150  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  28.44 
 
 
505 aa  150  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  28.68 
 
 
542 aa  149  2e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
501 aa  148  2e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  27.2 
 
 
492 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  28.2 
 
 
532 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  8.38838e-07  hitchhiker  2.62387e-05 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  34.09 
 
 
522 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.81227e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  29.76 
 
 
524 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 
506 aa  147  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  27.75 
 
 
506 aa  147  7e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
500 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
524 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
497 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.1 
 
 
479 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.97 
 
 
516 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  27.71 
 
 
504 aa  142  1e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>