79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3278 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  283  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  53.73 
 
 		 274 aa  140  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4387  hypothetical protein  49.26 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  41.3 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  34.27 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  32.62 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  40.16 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  36.29 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  36.59 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  34.71 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  30.37 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  31.39 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  32.12 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  31.34 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.46 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  34.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  34.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  34.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  30.4 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.89 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  33.86 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  34.15 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  27.78 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  32.5 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  32.85 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  30.66 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  28.8 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  28.8 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  28.8 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  33.09 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  29.92 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  33.86 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  27.08 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  29.66 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  31.06 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  28.68 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  29.41 
 
 		 451 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  30.7 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  30.7 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  31.47 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  31.96 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  32.52 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  31.71 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  30.28 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  27.61 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  29.46 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  32.2 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  28.03 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  31.85 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  30.49 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  51.43 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.97 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  25.86 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  32.54 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  25.86 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  25.86 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  26.15 
 
 		 180 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  28.87 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  27.82 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  30.56 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  30.28 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  30.28 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  33.61 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  30.28 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  30.65 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.71 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  29.84 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  29.13 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  32.2 
 
 		 133 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>