More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3248 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 369 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  69.81 
 
 		 373 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  65.94 
 
 		 369 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  65.67 
 
 		 369 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  65.67 
 
 		 369 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  65.94 
 
 		 369 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  65.67 
 
 		 369 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  67.3 
 
 		 373 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  66.76 
 
 		 369 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  66.21 
 
 		 367 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  66.49 
 
 		 369 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  66.21 
 
 		 369 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  63.56 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  63.01 
 
 		 380 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  61.2 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  62.19 
 
 		 380 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  66.57 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  66.47 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  66.27 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  56.25 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  53.59 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  53.31 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  52.33 
 
 		 366 aa  358  6e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  48.13 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  43.94 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  40.47 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  42.72 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.47 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  40.47 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  40.47 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  42.49 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  42.38 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  40.18 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  36.96 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  42.04 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.95 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  40.51 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  36.98 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  34.85 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  37.59 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  39.05 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  37.59 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  34.33 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.92 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  36.5 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.39 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  35.69 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  39.25 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  36.39 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  39.25 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  42.17 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  36.39 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.66 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  37.28 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.57 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  35.33 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  38.35 
 
 		 336 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  41.7 
 
 		 307 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  40.56 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  36 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  35.05 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  36.97 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  37.41 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.02 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  37.77 
 
 		 309 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.13 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  38.04 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  36.58 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  41.11 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  34.56 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  37.45 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  42 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  36.69 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  37.15 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  32.83 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  39.42 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  41.9 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.27 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  38.46 
 
 		 399 aa  169  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  38.46 
 
 		 399 aa  169  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  35.93 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  35.38 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  43.35 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  41.46 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  38.04 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  32.89 
 
 		 807 aa  166  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 314 aa  167  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  36.7 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  36.94 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  36.62 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  37.61 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  35.96 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  35.59 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.46 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.05 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>