More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3242 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  100 
 
 
573 aa  1166    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  69.06 
 
 
564 aa  779    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  50 
 
 
573 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  47.66 
 
 
576 aa  505  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  47.87 
 
 
564 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  46.48 
 
 
569 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  47.32 
 
 
569 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  37.34 
 
 
613 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  36.54 
 
 
608 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  37.64 
 
 
542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  34.84 
 
 
560 aa  301  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  37.72 
 
 
574 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  36.43 
 
 
542 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  34.57 
 
 
544 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  36.3 
 
 
565 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  34.85 
 
 
569 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  33.39 
 
 
543 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  34.57 
 
 
575 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  34.35 
 
 
535 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.75 
 
 
537 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  32.08 
 
 
596 aa  259  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  33.15 
 
 
541 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.23 
 
 
532 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.51 
 
 
574 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.5 
 
 
560 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.51 
 
 
545 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.52 
 
 
538 aa  233  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  31.86 
 
 
529 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  33.1 
 
 
606 aa  231  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.77 
 
 
556 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.34 
 
 
556 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.1 
 
 
616 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.6 
 
 
565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.63 
 
 
553 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.16 
 
 
545 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  30.59 
 
 
585 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.78 
 
 
533 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  30.17 
 
 
565 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.04 
 
 
556 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.69 
 
 
522 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  32.01 
 
 
589 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  30.56 
 
 
550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.82 
 
 
564 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.5 
 
 
530 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.63 
 
 
603 aa  213  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  32.44 
 
 
583 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  32.44 
 
 
583 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.87 
 
 
522 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.34 
 
 
543 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.85 
 
 
544 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.24 
 
 
601 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  30.96 
 
 
580 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.33 
 
 
522 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.33 
 
 
522 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  29.27 
 
 
522 aa  210  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.33 
 
 
522 aa  210  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.33 
 
 
522 aa  210  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  29.51 
 
 
522 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.51 
 
 
522 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  31.44 
 
 
620 aa  207  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.99 
 
 
522 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.94 
 
 
580 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  32.8 
 
 
548 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 
543 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  30.7 
 
 
553 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.96 
 
 
522 aa  203  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.39 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.94 
 
 
546 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.52 
 
 
564 aa  200  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.52 
 
 
584 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  30.43 
 
 
552 aa  197  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  31.8 
 
 
544 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  30.74 
 
 
553 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.3 
 
 
544 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.9 
 
 
575 aa  191  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.46 
 
 
557 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.32 
 
 
549 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.9 
 
 
575 aa  190  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.95 
 
 
527 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.21 
 
 
543 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.64 
 
 
583 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.71 
 
 
546 aa  187  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  29.88 
 
 
576 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.12 
 
 
539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.16 
 
 
619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.23 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.87 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.46 
 
 
583 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.45 
 
 
560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.58 
 
 
547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.41 
 
 
582 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.29 
 
 
543 aa  182  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  29.1 
 
 
560 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.37 
 
 
557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
563 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  28.21 
 
 
583 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
563 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  28.04 
 
 
583 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.5 
 
 
530 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.2 
 
 
548 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>