More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3146 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  56.4 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  50.74 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  46.85 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  44.18 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  42.86 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  43.72 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  42.06 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  45.34 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  42.91 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  41.86 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  42.06 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  41.47 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  41.27 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  41.27 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  43.9 
 
 		 281 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  40.64 
 
 		 282 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  40.48 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  40.48 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  40.08 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  38.65 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  38.49 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  42.02 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  39.92 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  42.02 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  39.43 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  40.1 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  44.05 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  40.93 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  41.08 
 
 		 282 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  40.91 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  45.24 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  42.77 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  42.17 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  42.17 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  44.05 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  41.57 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  40.5 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  38.12 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.37 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  47.24 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  42.41 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  42.61 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  38.06 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  38.06 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  42.94 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.72 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  30 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  40.52 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  40.14 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.7 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  36.11 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  36.6 
 
 		 322 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  37.33 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  44.96 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  31.91 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  34.53 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  36.47 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  41.6 
 
 		 395 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  34.46 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  36.36 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  40.62 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.25 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  38.67 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  33.81 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  36.67 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  36.96 
 
 		 367 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  36.11 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  38.37 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  32.97 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  32.97 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  43.09 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  41.06 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  32.42 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  37.2 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  42.86 
 
 		 141 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  34.32 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  40 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  37.7 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  39.84 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  31.98 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  42.75 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.32 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  27.23 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 399 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  36.31 
 
 		 469 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  40.48 
 
 		 412 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  35.94 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  41.86 
 
 		 402 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.84 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.89 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  37.7 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.27 
 
 		 399 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  40.94 
 
 		 420 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  38.02 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.68 
 
 		 425 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>