More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3141 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  100 
 
 		 625 aa  1238    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  32.68 
 
 		 636 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 1406 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  31.05 
 
 		 624 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 697 aa  163  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  31.5 
 
 		 525 aa  146  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.26 
 
 		 1764 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  27.82 
 
 		 725 aa  143  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.5 
 
 		 695 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 530 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.8 
 
 		 637 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  28.65 
 
 		 700 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 530 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 685 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  27.5 
 
 		 648 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  26.86 
 
 		 669 aa  130  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  26.65 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  29.01 
 
 		 536 aa  127  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  26.24 
 
 		 673 aa  127  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.77 
 
 		 762 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.77 
 
 		 762 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  25.96 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  27.06 
 
 		 656 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  25.77 
 
 		 889 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  27.13 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  33 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  29.65 
 
 		 677 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  25.47 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  25.23 
 
 		 899 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.94 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 		 604 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.49 
 
 		 549 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  31.86 
 
 		 626 aa  104  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  23.11 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  22.46 
 
 		 514 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  24.68 
 
 		 634 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  23.68 
 
 		 546 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 573 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  27.97 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 502 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 494 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  23.4 
 
 		 594 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 598 aa  97.4  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  28.31 
 
 		 742 aa  96.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  22.06 
 
 		 529 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  27.24 
 
 		 524 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  29.08 
 
 		 717 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  22.73 
 
 		 548 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  29.08 
 
 		 322 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  30.54 
 
 		 670 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  20.48 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  26.02 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  25.98 
 
 		 720 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 878 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 713 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.1 
 
 		 875 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 681 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  24.9 
 
 		 531 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.75 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 639 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.09 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.51 
 
 		 661 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.02 
 
 		 714 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 635 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 635 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  26.06 
 
 		 533 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 611 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 3035 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  29.71 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  28.63 
 
 		 266 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.14 
 
 		 689 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.17 
 
 		 626 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 637 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.91 
 
 		 3145 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 789 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 612 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 637 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  30 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 828 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.64 
 
 		 865 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 909 aa  70.5  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 739 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.38 
 
 		 622 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.51 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.67 
 
 		 626 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 714 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.67 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.39 
 
 		 725 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.67 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.98 
 
 		 816 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>