More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3137 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  100 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  37.65 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  43.97 
 
 		 474 aa  161  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  33.05 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.39 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  31.69 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  33.2 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  30.18 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.2 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.69 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30.58 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.58 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.63 
 
 		 558 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.85 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  26.92 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  35.35 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  32.31 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  29.44 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.47 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34.56 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  30.28 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  34.1 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.04 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  35.92 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.84 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  30.88 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  32.97 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  27.63 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.66 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.7 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.11 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.28 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  37.42 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  28.3 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  28.99 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  35.21 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  35.21 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  35.21 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  25.61 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  26.21 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  28.44 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  25.21 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  34.51 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  34.51 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  34.51 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  34.51 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  34.51 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.2 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  31.08 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  30.54 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  29.28 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  30.05 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  28.48 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  24.83 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  35.98 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  28.08 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  32.84 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  28.85 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  34.04 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  34.04 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  32 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  29.94 
 
 		 309 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  30.94 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  31.69 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 315 aa  62  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  34.04 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  26.48 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  34.51 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  33.8 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  23.21 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  35.4 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  33.8 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  23.48 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  23.48 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  27.23 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  39.5 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>