More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3055 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 277 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  46.35 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  34.81 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  32.59 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 289 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  33.33 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  33.73 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  32.38 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 298 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.83 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3771  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3844  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.01 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.59 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.59 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.59 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.59 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.59 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  25.59 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.32 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  28.16 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>