More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2952 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
695 aa  1379    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  61.28 
 
 
720 aa  807    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  46.43 
 
 
692 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  44.7 
 
 
685 aa  588  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  43.22 
 
 
698 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  43.96 
 
 
704 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.22 
 
 
701 aa  549  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.01 
 
 
686 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.93 
 
 
682 aa  328  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.83 
 
 
673 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.29 
 
 
670 aa  313  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  33.72 
 
 
729 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.18 
 
 
674 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.5 
 
 
677 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.03 
 
 
674 aa  303  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33 
 
 
708 aa  302  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  34.67 
 
 
674 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.08 
 
 
697 aa  293  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.3 
 
 
667 aa  273  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.39 
 
 
652 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.3 
 
 
687 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  29.43 
 
 
656 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  29.26 
 
 
656 aa  256  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.03 
 
 
726 aa  256  9e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.68 
 
 
762 aa  253  7e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.99 
 
 
642 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.95 
 
 
617 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.84 
 
 
688 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.84 
 
 
720 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.98 
 
 
664 aa  227  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.95 
 
 
692 aa  227  7e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.55 
 
 
665 aa  224  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 
681 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
690 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.74 
 
 
667 aa  216  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.3 
 
 
660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.12 
 
 
700 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  26.44 
 
 
688 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.51 
 
 
661 aa  211  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
680 aa  210  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  28.77 
 
 
632 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.65 
 
 
766 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
681 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.34 
 
 
666 aa  207  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
681 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
675 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  26.7 
 
 
675 aa  205  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
681 aa  205  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.92 
 
 
664 aa  203  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0732  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.4 
 
 
626 aa  203  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.517111 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  25.64 
 
 
655 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.63 
 
 
701 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.64 
 
 
622 aa  201  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  25.96 
 
 
652 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.34 
 
 
668 aa  200  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1306  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.23 
 
 
651 aa  198  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.11 
 
 
634 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  29.71 
 
 
618 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 
675 aa  196  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.23 
 
 
673 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.08 
 
 
698 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.83 
 
 
673 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.23 
 
 
698 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.81 
 
 
655 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.3 
 
 
654 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  25.3 
 
 
655 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  25.3 
 
 
654 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27440  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.67 
 
 
681 aa  193  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2311  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.87 
 
 
654 aa  191  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.22 
 
 
652 aa  191  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.07 
 
 
668 aa  190  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.44 
 
 
655 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.59 
 
 
680 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.1 
 
 
620 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.7 
 
 
709 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  24.62 
 
 
654 aa  187  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
686 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0810  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.01 
 
 
719 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0412357  normal  0.0214856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.54 
 
 
669 aa  185  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.85 
 
 
654 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.79 
 
 
735 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.28 
 
 
683 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.29 
 
 
685 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.66 
 
 
683 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  24.44 
 
 
656 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.51 
 
 
683 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.51 
 
 
683 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.19 
 
 
655 aa  179  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.51 
 
 
682 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  24.67 
 
 
648 aa  177  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0507  Acylaminoacyl-peptidase  25.38 
 
 
591 aa  177  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.54 
 
 
698 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  24.68 
 
 
684 aa  177  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.48 
 
 
631 aa  177  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  26.15 
 
 
717 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.9 
 
 
688 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.78 
 
 
687 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.01 
 
 
648 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  25 
 
 
695 aa  173  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.82 
 
 
687 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>