121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2912 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  57.87 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  57.75 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.5 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  55.61 
 
 		 238 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  48.21 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  47.77 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  48.11 
 
 		 238 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.65 
 
 		 249 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.83 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.88 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  47.8 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  45.03 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.89 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  45.99 
 
 		 231 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.6 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.95 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  46.7 
 
 		 236 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.52 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.41 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.94 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.27 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.6 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.6 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  43.92 
 
 		 235 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  45.65 
 
 		 213 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.3 
 
 		 243 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.15 
 
 		 235 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.13 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  44.92 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  43.3 
 
 		 214 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  45 
 
 		 237 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  44.02 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.11 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.09 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.78 
 
 		 215 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.48 
 
 		 215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  43.48 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  37.31 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  37.63 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.1 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.66 
 
 		 221 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.54 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.96 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  36.9 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.37 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  36.76 
 
 		 334 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.64 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.88 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  34.95 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  31.15 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  39.25 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.25 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.17 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  36.56 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.14 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  29 
 
 		 214 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.95 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.02 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.41 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.02 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 267 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  30.69 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.82 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  25.37 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  29.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  29.93 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  29.35 
 
 		 190 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  26.84 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  44.9 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  27.27 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 363 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.94 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  27.72 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  70.59 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  35.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  45.45 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  28.07 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  45.45 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23800  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  41.54 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 		 218 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.14 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.4 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25.66 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  34.31 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  30.1 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  30.1 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>