More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2906 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  82.77 
 
 		 271 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  82.35 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  67.36 
 
 		 244 aa  332  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  66.67 
 
 		 310 aa  321  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  65.55 
 
 		 288 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  64.73 
 
 		 253 aa  318  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  63.35 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  64.34 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  62.14 
 
 		 252 aa  315  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  61.6 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.82 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  63.05 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  65.4 
 
 		 321 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  64.49 
 
 		 258 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  64.56 
 
 		 316 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  61.76 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  61.76 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  61.34 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  60.78 
 
 		 311 aa  309  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  64.08 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  64.56 
 
 		 332 aa  308  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.09 
 
 		 268 aa  308  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  60.64 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  63.71 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  63.71 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  61.6 
 
 		 256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  61.07 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  60.7 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  64.14 
 
 		 333 aa  305  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  63.27 
 
 		 270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  64.14 
 
 		 283 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  60.5 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 264 aa  299  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  62.87 
 
 		 290 aa  297  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  62.87 
 
 		 289 aa  297  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  61.02 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  57.81 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.72 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  62.87 
 
 		 282 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  63.71 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  54.85 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  55.27 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  58.4 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  59.07 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.56 
 
 		 241 aa  288  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  54.85 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.14 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  61.76 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  54.85 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  58.23 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  56.02 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  54.01 
 
 		 244 aa  284  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  55.26 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.56 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  58.82 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.08 
 
 		 254 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  55.86 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  55.86 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  55.86 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  56.72 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.55 
 
 		 241 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  59.66 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  55.86 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.25 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  60.34 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  55.47 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  56.85 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  54.2 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  56.25 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 245 aa  278  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  57.26 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  55.86 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  55.04 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  54.01 
 
 		 244 aa  278  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 249 aa  278  9e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 249 aa  278  9e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  59.66 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  61.47 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>