More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2798 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
272 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  61 
 
 
242 aa  304  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  64.46 
 
 
246 aa  285  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  52.55 
 
 
256 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.57 
 
 
254 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.63 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.11 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.93 
 
 
242 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.81 
 
 
256 aa  238  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 
248 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  42.59 
 
 
262 aa  236  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.06 
 
 
278 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.56 
 
 
257 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.03 
 
 
256 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.58 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.22 
 
 
260 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  46.22 
 
 
257 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  49.78 
 
 
227 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  48.54 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.33 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.75 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  44 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  45.29 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.44 
 
 
255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.52 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.88 
 
 
255 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  50.44 
 
 
255 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
258 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.68 
 
 
259 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.1 
 
 
259 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.44 
 
 
259 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  44 
 
 
255 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.1 
 
 
259 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.52 
 
 
258 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.78 
 
 
256 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  46.12 
 
 
255 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 
257 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.07 
 
 
256 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  41.18 
 
 
255 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
256 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.89 
 
 
255 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  42.67 
 
 
255 aa  202  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.86 
 
 
258 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.67 
 
 
256 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.75 
 
 
258 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.35 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0966  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.27 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  40.86 
 
 
257 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.61 
 
 
256 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  48.65 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.57 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.94 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.98 
 
 
257 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.25 
 
 
257 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  47.7 
 
 
284 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.54 
 
 
257 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  45.38 
 
 
252 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  44.69 
 
 
256 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.09 
 
 
259 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.56 
 
 
255 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.13 
 
 
273 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.19 
 
 
266 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  40.89 
 
 
255 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 
271 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.26 
 
 
256 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.51 
 
 
256 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.67 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.33 
 
 
257 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.54 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.59 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.16 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.6 
 
 
255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.16 
 
 
263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
263 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.2 
 
 
259 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.56 
 
 
266 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.16 
 
 
263 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.97 
 
 
248 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
259 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05621  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  40.59 
 
 
253 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  48.07 
 
 
266 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.7 
 
 
257 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.69 
 
 
282 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.7 
 
 
257 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  38.24 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  40.08 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  39.47 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.44 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05851  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  37.66 
 
 
303 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.597895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.26 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.53 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 
256 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.55 
 
 
273 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.55 
 
 
273 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.49 
 
 
252 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.54 
 
 
259 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>