178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2796 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  100 
 
 
318 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  71.8 
 
 
309 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  71.8 
 
 
309 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  70.16 
 
 
308 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  70.07 
 
 
311 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  68.63 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  69.38 
 
 
311 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  68.42 
 
 
311 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  69.74 
 
 
315 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  67.21 
 
 
309 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  68.3 
 
 
309 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  66.88 
 
 
309 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  67.32 
 
 
309 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  66.99 
 
 
309 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  66.99 
 
 
309 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  65.47 
 
 
309 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  65.36 
 
 
306 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  62.5 
 
 
306 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  51.96 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  52.29 
 
 
304 aa  317  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  52.65 
 
 
304 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  51.8 
 
 
304 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  53.23 
 
 
306 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  52.79 
 
 
306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  52.13 
 
 
304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3965  Glutaminase  53.72 
 
 
306 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  53.23 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  54.67 
 
 
308 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  50.82 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  54.67 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  50.82 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  54.67 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  52.09 
 
 
316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  50.32 
 
 
307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  50.33 
 
 
304 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  50.49 
 
 
304 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  50.16 
 
 
333 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  50.65 
 
 
304 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  50.49 
 
 
304 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  49.84 
 
 
346 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  52.15 
 
 
316 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0137  Glutaminase  55.34 
 
 
312 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2487  glutaminase  52.13 
 
 
304 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.702442  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  51.32 
 
 
307 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1322  glutaminase  49.51 
 
 
304 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  50 
 
 
302 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  49.04 
 
 
304 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  51.22 
 
 
303 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  50 
 
 
304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  48.52 
 
 
308 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0977  Glutaminase  47.18 
 
 
304 aa  288  7e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  49.18 
 
 
304 aa  288  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  50.16 
 
 
302 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  49.84 
 
 
306 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  50 
 
 
304 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  48.52 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  49.67 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  51.48 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  49.68 
 
 
304 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  49.68 
 
 
304 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  49.68 
 
 
304 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  49.35 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  49.35 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  49.35 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  50.65 
 
 
304 aa  285  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3548  L-glutaminase  49.04 
 
 
314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1111  glutaminase  49.68 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000036158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  52.76 
 
 
308 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  52.76 
 
 
308 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  52.76 
 
 
308 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  52.76 
 
 
308 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  48.85 
 
 
304 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  48.85 
 
 
302 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  50.49 
 
 
308 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0139  glutaminase  52.13 
 
 
302 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01329  glutaminase  49.18 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  48.78 
 
 
306 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2007  glutaminase  48.51 
 
 
308 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3373  glutaminase  48.85 
 
 
302 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  44.98 
 
 
333 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  40.8 
 
 
308 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  41.03 
 
 
305 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  41.03 
 
 
305 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  41.67 
 
 
307 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4370  glutaminase  40.13 
 
 
297 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0794447  normal  0.786087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>