34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2793 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  320  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  51.45 
 
 
166 aa  109  1e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  44.06 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  26 
 
 
227 aa  62.8  2e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  28.47 
 
 
175 aa  58.9  3e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  26.25 
 
 
182 aa  57.8  7e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  27.4 
 
 
186 aa  57.4  9e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  23.68 
 
 
204 aa  57  1e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  23.68 
 
 
167 aa  57  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  24.38 
 
 
182 aa  55.5  3e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  24.31 
 
 
178 aa  54.7  6e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  24.31 
 
 
192 aa  54.3  6e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  23.03 
 
 
167 aa  53.5  1e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  24.31 
 
 
191 aa  53.5  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  23.61 
 
 
199 aa  53.1  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  27.81 
 
 
169 aa  52.4  2e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  27.21 
 
 
175 aa  52.4  3e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  22.31 
 
 
169 aa  52  4e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  51.2  5e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  26.24 
 
 
168 aa  51.2  6e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  22.31 
 
 
169 aa  51.2  6e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  23.08 
 
 
167 aa  51.2  6e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  27.89 
 
 
182 aa  51.2  7e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  24.09 
 
 
175 aa  50.4  1e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  26.95 
 
 
241 aa  49.3  2e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  24.66 
 
 
177 aa  48.9  3e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  25.6 
 
 
173 aa  48.5  3e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  22.22 
 
 
169 aa  48.9  3e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  25.74 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  25.33 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  22.14 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  22.14 
 
 
176 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  22.14 
 
 
176 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>