146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2757 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  61.63 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  55.27 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  47.95 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  46.72 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  47.95 
 
 		 248 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  46.31 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  48.55 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  45.8 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  46.25 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  46.91 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  42.15 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  49.78 
 
 		 264 aa  177  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  47.33 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  46.86 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  46.91 
 
 		 647 aa  174  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  46.25 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  44.92 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  49.78 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  43.57 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  47.7 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  47.95 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  45.98 
 
 		 274 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  44.94 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  44.54 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  45.54 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  43.37 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  45.61 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  39.09 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  46.03 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  41.77 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  31.71 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  46.96 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  43.03 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  42.19 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  41.59 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  46.29 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  43.48 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  32.91 
 
 		 279 aa  125  4.0000000000000003e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  30.26 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  30.26 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.78 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  30.7 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  26.78 
 
 		 408 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  24.2 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  29.19 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  29.24 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  28.65 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  29.26 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  29.9 
 
 		 413 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  31.84 
 
 		 407 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  29.89 
 
 		 409 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  29.17 
 
 		 397 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  29.03 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.24 
 
 		 642 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  23.63 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 522 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.51 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.97 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.1 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  33.82 
 
 		 663 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 361 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  29.02 
 
 		 405 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.32 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  22.97 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  22.67 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  32.29 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  30.88 
 
 		 690 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  35.44 
 
 		 405 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.05 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  27.23 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  32.29 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  29.84 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.88 
 
 		 726 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  25.82 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.09 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 311 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  31.88 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  26.63 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  26.54 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  27.27 
 
 		 670 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  27.52 
 
 		 679 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>