More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2644 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
394 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  58.24 
 
 
383 aa  478  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  57.34 
 
 
383 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  59.73 
 
 
384 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  54.03 
 
 
385 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  51.3 
 
 
383 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  55.21 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.42 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  52.55 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.6 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.42 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.88 
 
 
386 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  50.53 
 
 
385 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.39 
 
 
395 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.92 
 
 
391 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.89 
 
 
392 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.92 
 
 
391 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.53 
 
 
399 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.01 
 
 
383 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  44.62 
 
 
380 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  44.35 
 
 
381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.79 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.44 
 
 
395 aa  323  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  40.05 
 
 
407 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  40.47 
 
 
395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.11 
 
 
398 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  43.28 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.16 
 
 
368 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.34 
 
 
389 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.49 
 
 
380 aa  259  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.64 
 
 
372 aa  246  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.6 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.24 
 
 
391 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  40.22 
 
 
368 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.06 
 
 
381 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.09 
 
 
384 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.2 
 
 
365 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.74 
 
 
382 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.61 
 
 
368 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.69 
 
 
381 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  33.61 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.2 
 
 
387 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.44 
 
 
367 aa  217  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  33.98 
 
 
371 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  33.52 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.01 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.43 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.26 
 
 
375 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.34 
 
 
384 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  31.55 
 
 
365 aa  210  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.05 
 
 
371 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.05 
 
 
371 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.14 
 
 
372 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  34.07 
 
 
363 aa  205  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  32.43 
 
 
500 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.78 
 
 
379 aa  203  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.7 
 
 
507 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  33.52 
 
 
364 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  30.79 
 
 
364 aa  201  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  33.24 
 
 
363 aa  200  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  33.33 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  31.1 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  31.88 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  31.37 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  31.37 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.87 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.09 
 
 
500 aa  195  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  34.81 
 
 
383 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.91 
 
 
372 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.98 
 
 
381 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  29.58 
 
 
386 aa  186  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.59 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.83 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1938  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.33 
 
 
397 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.38 
 
 
403 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.96 
 
 
383 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.96 
 
 
383 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.88 
 
 
370 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0427  glutamine--scyllo-inositol transaminase  26.85 
 
 
374 aa  176  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0732605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  29.2 
 
 
368 aa  176  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.81 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3986  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.74 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0364  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.04 
 
 
383 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2049  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.84 
 
 
401 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  29.69 
 
 
591 aa  169  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3898  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.14 
 
 
388 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0502  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.85 
 
 
372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.374086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.76 
 
 
366 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.56 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  29.33 
 
 
586 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  29.33 
 
 
586 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  29.33 
 
 
591 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3035  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.45 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0346  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.44 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0711  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  31.55 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1998  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.64 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8499  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.51 
 
 
387 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0121  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.92 
 
 
358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1834  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.94 
 
 
363 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272611  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1135  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  27.93 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>