57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2603 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  291  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  56.13 
 
 
156 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  45.27 
 
 
145 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  43.54 
 
 
146 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  41.22 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  42.67 
 
 
150 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  41.72 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  41.72 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  39.07 
 
 
155 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  40.41 
 
 
145 aa  103  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  42 
 
 
148 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  42 
 
 
148 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  42 
 
 
148 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  41.06 
 
 
145 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  41.33 
 
 
148 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  38.41 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  40.79 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  39.47 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  36.91 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  42.4 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  46.3 
 
 
206 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  38.26 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  40.27 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  35.71 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  37.97 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  36.36 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  33.08 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  38.52 
 
 
167 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  37.96 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  38.66 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  33.11 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  32.43 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  29.61 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  31.03 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  34.59 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
201 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  29.81 
 
 
148 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000026195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  32.19 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  27.15 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  29.06 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  31.96 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  31.96 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  30.23 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  30.89 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  34.78 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  26.8 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  31.96 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0055  hypothetical protein  24.82 
 
 
240 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  32.74 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4068  hypothetical protein  40.86 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258336  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  30.08 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  29.8 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  36.67 
 
 
200 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  31.97 
 
 
159 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>