69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2541 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  56.85 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  57.54 
 
 		 228 aa  231  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.71 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.46 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  31.87 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  33.33 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.06 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.09 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  30.06 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.19 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.09 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.17 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.09 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.87 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  30.48 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.48 
 
 		 302 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  29.8 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  29.8 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.21 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.42 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  32.12 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.24 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.18 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.17 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.61 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.9 
 
 		 314 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.45 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.14 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.77 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.02 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.02 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.48 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.95 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.86 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.19 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  24.88 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.17 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.38 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2459  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.34 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00395649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.58 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.73 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.3 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.23 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.71 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.13 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.66 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.88 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.46 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.34 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  21.97 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.92 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.3 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.08 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  22.99 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.99 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1160  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.14 
 
 		 227 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  29.76 
 
 		 202 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>