71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2515 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 221 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  37.63 
 
 		 226 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  40.23 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  39.44 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  37.93 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 236 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 191 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  33.98 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 		 210 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 		 210 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 245 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 188 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>