More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2500 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 733 aa  1471    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  36.26 
 
 		 695 aa  386  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 700 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 713 aa  334  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 767 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 702 aa  317  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 737 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 732 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 685 aa  295  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 718 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 720 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 763 aa  280  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 703 aa  280  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 732 aa  264  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 713 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 792 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 841 aa  257  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 730 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.94 
 
 		 715 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 790 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 784 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 818 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 759 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 790 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 739 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 710 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 761 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 722 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 769 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 764 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 753 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.75 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 803 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 734 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 741 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 794 aa  220  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 743 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 757 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 808 aa  220  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 747 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 775 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 687 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 737 aa  213  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 751 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 774 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 764 aa  211  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 761 aa  210  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 741 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 736 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 724 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 778 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 771 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 729 aa  208  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 758 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 777 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 804 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 725 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 773 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 783 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 778 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 763 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 779 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 746 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 726 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 755 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 731 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 762 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 773 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 766 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 802 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 764 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 794 aa  201  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 720 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.65 
 
 		 784 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 757 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 803 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 		 776 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 765 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 790 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 728 aa  195  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 726 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 786 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 733 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 797 aa  194  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 822 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 723 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 779 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 732 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 787 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 688 aa  192  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 756 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 720 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 690 aa  191  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>