More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2462 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 412 aa  834    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  57.86 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  51.75 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  52.64 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.63 
 
 		 362 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 421 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 		 415 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  32.17 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 		 434 aa  143  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.77 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.36 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.57 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.74 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.57 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.67 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  32.52 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  32.54 
 
 		 379 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.97 
 
 		 345 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  30.07 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.69 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.42 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 		 671 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.7 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.27 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.72 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.59 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.91 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  35.47 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.45 
 
 		 328 aa  111  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.51 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 652 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.37 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.54 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  28.2 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 		 698 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  31.06 
 
 		 689 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 		 310 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 320 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 		 727 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.4 
 
 		 488 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 		 370 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  27.17 
 
 		 352 aa  106  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  36.87 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  36.87 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.92 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  26.74 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 632 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  30.64 
 
 		 686 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  31.18 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.29 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>