More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2457 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  66.02 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  61.54 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  57.42 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  61.06 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  56.94 
 
 		 212 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  57.35 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  58.13 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  56.94 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  57.35 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  57.77 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  55.02 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  55.98 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  54.55 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  55.61 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  57.35 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  60.1 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  57.07 
 
 		 217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  58.2 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  54.95 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  50.74 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  61.38 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  54.68 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  50.74 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  56.16 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  56.16 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  49.27 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  49.75 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  48.29 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  52.38 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  55.12 
 
 		 212 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  54.59 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  47.29 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  52.17 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  54.59 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  54.37 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  46.57 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  43.35 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.44 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.44 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  56.08 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  45.05 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  35.38 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.78 
 
 		 667 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.98 
 
 		 670 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.83 
 
 		 673 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.24 
 
 		 675 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.62 
 
 		 643 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  36.77 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  43.93 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  43.93 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  43.93 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.83 
 
 		 673 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  37.84 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 255 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.12 
 
 		 699 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.43 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.34 
 
 		 668 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>