215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2432 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  89.39 
 
 		 67 aa  123  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  82.09 
 
 		 67 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  64.18 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 66 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  59.09 
 
 		 66 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 66 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  60.61 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  59.7 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  61.19 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  59.7 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  59.7 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  56.72 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  62.3 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  62.3 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  62.3 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  62.3 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  64.81 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  57.58 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  60.66 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  56.92 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  60.66 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 68 aa  67  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  39.39 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  44.44 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  45.76 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  45.76 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  51.85 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  45.76 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  45.76 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  42.19 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  42.37 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  42.37 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  46.3 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>