More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2431 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 125 aa  247  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  85.12 
 
 		 121 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0686  50S ribosomal protein L20  80.91 
 
 		 120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.499897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  72.5 
 
 		 121 aa  177  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  72.65 
 
 		 133 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  68.6 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  68.6 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 		 134 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  69.23 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  69.75 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  70.09 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  70.09 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 125 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  69.23 
 
 		 119 aa  167  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  69.23 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  69.75 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1191  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  66.67 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  67.2 
 
 		 125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 119 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  69.42 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 119 aa  157  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  65.55 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 119 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0044  50S ribosomal protein L20  69.81 
 
 		 119 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0039  50S ribosomal protein L20  68.87 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  150  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  149  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0448  50S ribosomal protein L20  67.92 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0165  50S ribosomal protein L20  67.92 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  63.79 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  60.33 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  146  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  58.4 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  59.32 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  60.68 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  58.82 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  60.5 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>