268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2250 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.53 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  37.44 
 
 
209 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.82 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.75 
 
 
210 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.45 
 
 
222 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.92 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.92 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  33.84 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.29 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 
208 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
210 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 
202 aa  98.2  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.97 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.89 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  32.95 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.1 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.1 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.71 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.91 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.91 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.95 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.73 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  32.35 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  31.12 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  31.12 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  31.12 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.03 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  29.73 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  29.73 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  30.23 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  29.73 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  29.35 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.2 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  29.73 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  31 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.99 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  28.99 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  29.19 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.76 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.12 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.38 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  29.19 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.15 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  29.38 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  29.38 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.26 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  29.38 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.32 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.32 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.32 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.32 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.84 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.32 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.67 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.67 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.83 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.67 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  31.46 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  28.91 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.04 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  28.65 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  28.91 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  30.22 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  28.91 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.04 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  29.19 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.02 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.79 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  30.77 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.42 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.02 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  29.77 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  33.52 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.21 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.56 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  32.18 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  26.37 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  29.77 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  29.77 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.49 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  26.37 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  26.37 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.74 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  28.11 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  31.28 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  26.37 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  26.37 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  28.44 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>