216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2247 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  444  1e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2524  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.77 
 
 
234 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  40.18 
 
 
230 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  46.43 
 
 
230 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  39.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  39.91 
 
 
228 aa  173  2e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  44.14 
 
 
246 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.07 
 
 
228 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  43.5 
 
 
226 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.53 
 
 
230 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  44.59 
 
 
225 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.53 
 
 
232 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.53 
 
 
230 aa  166  3e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  42.79 
 
 
245 aa  166  3e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.94 
 
 
229 aa  166  3e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.65 
 
 
230 aa  166  3e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  38.22 
 
 
267 aa  165  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.02 
 
 
228 aa  165  6e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 
230 aa  164  1e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  44.84 
 
 
227 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.73 
 
 
225 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.46139e-07 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.58 
 
 
228 aa  161  8e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.52 
 
 
225 aa  161  8e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.15 
 
 
227 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  41.26 
 
 
230 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 
225 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  44.84 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  44.84 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  44.84 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  44.84 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  44.84 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  44.84 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  44.84 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  41.89 
 
 
227 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.79 
 
 
228 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  44.69 
 
 
228 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  37.14 
 
 
224 aa  158  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  38.33 
 
 
229 aa  158  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  38.57 
 
 
225 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  41.26 
 
 
267 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  40.09 
 
 
227 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  42.01 
 
 
230 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.55 
 
 
224 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 
227 aa  154  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.24 
 
 
225 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.99 
 
 
229 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  40.99 
 
 
230 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  37.67 
 
 
227 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.91 
 
 
235 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.81 
 
 
225 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  40.09 
 
 
234 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  37.61 
 
 
221 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  38.91 
 
 
230 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  39.19 
 
 
226 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 
231 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.19 
 
 
224 aa  152  3e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  41.44 
 
 
225 aa  152  3e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  39.38 
 
 
223 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  39.01 
 
 
225 aa  152  6e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  37.73 
 
 
273 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
228 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.34 
 
 
227 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.68 
 
 
227 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  38.57 
 
 
223 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  38.6 
 
 
223 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  39.46 
 
 
225 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 
224 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  42.59 
 
 
229 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  38.29 
 
 
257 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  43.24 
 
 
227 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  37.84 
 
 
225 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  40.36 
 
 
227 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  34.21 
 
 
229 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  38.84 
 
 
235 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  33.77 
 
 
229 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.89 
 
 
255 aa  148  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  33.77 
 
 
229 aa  147  1e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.38 
 
 
249 aa  147  1e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.84 
 
 
230 aa  147  1e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  38.6 
 
 
221 aa  146  2e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.64 
 
 
232 aa  147  2e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  39.82 
 
 
230 aa  146  2e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  33.33 
 
 
227 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  33.48 
 
 
227 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.11 
 
 
232 aa  145  4e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.82 
 
 
242 aa  145  4e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.71 
 
 
238 aa  145  4e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  38.94 
 
 
227 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.82 
 
 
258 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  36.48 
 
 
250 aa  144  8e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  39.55 
 
 
232 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  33.48 
 
 
227 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  33.48 
 
 
227 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.94 
 
 
227 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  38.12 
 
 
231 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  41.36 
 
 
226 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  37 
 
 
227 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.01 
 
 
231 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.53 
 
 
228 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  40.57 
 
 
225 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>