92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2196 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 955 aa  1937    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  42.62 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  35.53 
 
 		 624 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  28.81 
 
 		 749 aa  297  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  36.79 
 
 		 613 aa  280  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  31.34 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  32.35 
 
 		 717 aa  237  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  32.14 
 
 		 717 aa  235  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  32.08 
 
 		 717 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  31.02 
 
 		 798 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  30.42 
 
 		 695 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  30.68 
 
 		 524 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  30.28 
 
 		 755 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  32.9 
 
 		 782 aa  191  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  30.56 
 
 		 765 aa  191  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  32.25 
 
 		 760 aa  188  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  33.11 
 
 		 759 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  29.55 
 
 		 738 aa  184  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  35.67 
 
 		 462 aa  181  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  28.87 
 
 		 843 aa  180  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  34.57 
 
 		 482 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  28.69 
 
 		 900 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  30.08 
 
 		 746 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  28.87 
 
 		 842 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  30.08 
 
 		 746 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.52 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  26.73 
 
 		 882 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.57 
 
 		 970 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  28.6 
 
 		 774 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.84 
 
 		 970 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  30.86 
 
 		 770 aa  155  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  32.49 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  28.93 
 
 		 697 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  31.99 
 
 		 472 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  26.46 
 
 		 857 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  28.52 
 
 		 470 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  26.38 
 
 		 874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  26.38 
 
 		 874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  30.75 
 
 		 485 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  25.42 
 
 		 757 aa  131  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  27.07 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  34.19 
 
 		 450 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  28.79 
 
 		 725 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  23.52 
 
 		 788 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  29.69 
 
 		 526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  29.69 
 
 		 526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  34.95 
 
 		 377 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  34.88 
 
 		 479 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  32.04 
 
 		 391 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.79 
 
 		 283 aa  104  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.11 
 
 		 201 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.2 
 
 		 201 aa  101  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.83 
 
 		 283 aa  97.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  27.08 
 
 		 632 aa  94.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  31.6 
 
 		 266 aa  90.9  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.67 
 
 		 271 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  31.75 
 
 		 263 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  28.44 
 
 		 746 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  30.81 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  30.66 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.7 
 
 		 287 aa  80.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  32.49 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  26.61 
 
 		 290 aa  77  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  24 
 
 		 486 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  25.22 
 
 		 799 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.09 
 
 		 769 aa  70.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  31.53 
 
 		 667 aa  70.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.85 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  27.61 
 
 		 295 aa  67  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24.75 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.03 
 
 		 289 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  30.95 
 
 		 314 aa  62  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  21.11 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.12 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.21 
 
 		 304 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  21.26 
 
 		 486 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.66 
 
 		 206 aa  57.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.32 
 
 		 305 aa  56.6  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.77 
 
 		 1006 aa  54.7  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  39.05 
 
 		 756 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  29.82 
 
 		 317 aa  53.5  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  31.09 
 
 		 255 aa  53.5  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.19 
 
 		 1002 aa  53.5  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  20.89 
 
 		 606 aa  52.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  24.03 
 
 		 771 aa  52.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  33.72 
 
 		 183 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  21.36 
 
 		 739 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  28.64 
 
 		 220 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  22.73 
 
 		 636 aa  46.6  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.25 
 
 		 400 aa  45.8  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  23.08 
 
 		 1000 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.17 
 
 		 289 aa  45.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>