67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2183 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 91 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  45.65 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  39.56 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  39.56 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  41.3 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  43.62 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  41.3 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  37.63 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  37.63 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  39.13 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  45.65 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  39.56 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  33.7 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  32.61 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  33.7 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  33.33 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  30.43 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  30.11 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  34.38 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  29.21 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  31.25 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  30.21 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  31.87 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  37.89 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  30.93 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  27.17 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  35.59 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  34.78 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  29.79 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  27.17 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  30.21 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0416  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  35 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  30.53 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  31.96 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0213  proteic killer protein, putative  41.67 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42010  hypothetical protein  31.75 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  30.21 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  29.79 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  35 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  30.11 
 
 		 94 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>